水稻品種鑒別通常采用田間鑒定與室內鑒別相結合，以田間調查為主。

（一） 田間調查

田間鑒定的主要內容為純度、熟期和主要特征特性。生產上推廣應用的水稻品種（組合）的固有特征特性，在田間應表現整齊一致的特征特性，根據上述特征特性，可識別不同的水稻品種并且鑒別品種純度。品種純度一般用調查植株總數（或室內考種種籽總數）中具有本品種固有特征特性的植株數（或室內考種籽粒數）多少來表示。田間調查可采用在一塊田中隨機在田中心及四周（不包括邊行）五點取樣調查。田間調查除根據品種特征特性調查純度外，還可根據熟期調查純度，生產上應用的品種（組合）在特定地區都有相對穩定的生育期，不同年份之間品種（組合）生育期有一定變化，但變化不大，即在正常播插期內，特定地區秋前成熟早稻品種不會變為秋季成熟的中稻品種或秋后成熟的晚稻品種。

（二） 室內鑒定

室內鑒定包括種子鑒別法和理化檢測方法以及米質鑒別法。

種子鑒別法可根據不同品種種子谷粒長短厚度、稃尖顏色、芒的有無或長短、千粒重、稃毛多少等差異鑒別不同品種，如粳稻品種穎毛長而密，難脫粒，谷米短寬且厚，橫斷面近圓形；秈稻品種穎毛短而稀，散生穎面，易脫粒，谷米略扁平。

品種種子理化檢測方法有很多，大多數方法只能在特定科研機構進行